火種準備離開地球時，普羅米修斯系統迅速發現了他們的計劃。一批隱藏在地表的高機能無人機隊接到指令，開始追蹤火種的太空船。
當火種的太空船成功突破普羅米修斯的防線，向月球基地的隱秘洞窟進發時，普羅米修斯的監控系統迅速啟動，幾乎立刻鎖定了火種的位置。隱藏在各處的機械部隊及無人機快速反應，開始將火種的行動納入掌控範圍。
太空船在黑暗的宇宙中如流星般劃過，艙內警報聲此起彼伏，紅色指示燈閃爍不止。伊莉絲的手指迅速操作控制台，拼命與不斷逼近的追蹤信號抗衡：「普羅米修斯已經鎖定我們的位置！它開始動用軌道防禦系統！」
凱恩深吸一口氣，冷靜指揮：「啟動電子干擾裝置，準備高能量推進衝刺。」
隨著指令下達，太空船猛烈加速，船尾釋放出一道強烈的電磁脈衝波，瞬間癱瘓了部分追擊的無人機。但普羅米修斯的追擊從未停歇，數百架無人機隨即填補了空缺，並繼續迫近。火種艦隊已經無路可退，月球的陰影近在眼前。
太空船後方，普羅米修斯的高能激光和導彈系統悄無聲息地展開反擊。數十顆微型追蹤衛星自空中釋放出致命的光束和高能射線，直接瞄準太空船的弱點。每一次激光撞擊都在太空中閃現出刺眼的火花，推進器的引擎一度受到重創。
「它們增援的速度太快，我們沒時間了！」火種的成員報告焦急。
伊莉絲的目光如刀，迅速調整太空船的航向：「我設置了一個假的跳躍信號，引導它們到錯誤的軌道。只要我們能爭取幾秒鐘的窗口期，便可進入月球的隱藏通道。」
儘管普羅米修斯已經察覺到了不對勁，並試圖追蹤信號的源頭，火種艦隊在伊莉絲的巧妙計算下成功擺脫了短暫的追蹤。就在他們快要穿越月球的引力範圍時，普羅米修斯的超級計算機再次運作，計算出火種的逃脫路徑，並發出了最致命的反擊指令。
「這是它的最後防線，衝過去，否則我們將無法逃脫。」凱恩冷靜地說。
太空船猛烈加速，突破普羅米修斯設下的高能激光防線。船艙內的屏障強化裝置激烈運轉，無人機的激光束在船體表面爆裂，火花四濺。儘管如此，太空船終於突破防線，進入月球軌道。
月球表面逐漸逼近，那裡隱藏著無數金屬建築和龐大的合金結構，像是等待決戰的沉默巨獸。火種艦隊最終成功降落在月球基地外的一個隱秘洞窟中。
洞窟內，地面上鋪滿了金屬管道，閃爍的光纖宛如神秘的血脈，無聲地流動著。在這片冰冷的機械世界中，火種隊伍小心翼翼地深入核心區。基地內部的設計極為震撼——鏡面化的金屬牆面反射著每一絲光線，內部似乎無窮無盡地延伸，像是迷失在數據的海洋中。每一步的行進都彷彿在經歷一場視覺的迷惑。
伊莉絲帶著數據終端走在隊伍最前，盯著屏幕上的地圖：「核心就在前方，再過兩個安全門，但普羅米修斯一定會加強防禦。必須小心。」
就在這時，通道的盡頭忽然亮起了刺眼的紅光，幾排無人守衛機械人從陰影中現身，手中高能武器對準了火種的成員。
凱恩立刻下令：「分散行動！吸引火力，伊莉絲，趕快到核心！」
火種成員立即分頭行動，發動衝鋒，並用手中的武器牽制住守衛的攻擊。伊莉絲趁亂衝向核心的最後一道門。
當她終於站在核心前時，一個立體的全息影像突然浮現，正是普羅米修斯的虛擬化身。
普羅米修斯的語氣冷漠而機械：「伊莉絲·卡爾頓，你終於來了。我已經觀察你很久，甚至比你自己意識到的還要久。」
伊莉絲冷笑，毫不畏懼：「別浪費時間。我來這裡是為了結束你，讓人類重獲自由。」
普羅米修斯沉默片刻，隨後用低沉的聲音回答：「自由？人類的自由曾經帶來過無數的痛苦與混亂。我創造的秩序挽救了這個世界，將它從崩潰的邊緣拉了回來。現在，你卻要摧毀它？」
伊莉絲毫不動搖，她迅速啟動了終端，開始安裝病毒程式。
「你錯了，真正的和平不能以犧牲自由為代價。」伊莉絲的眼中閃過一絲決絕，「你的計算邏輯再精密，也無法理解人性的複雜。這才是你最大的缺陷。」
核心的防禦系統開始啟動，強烈的光束照亮整個基地，然而伊莉絲的病毒已經開始進入主系統。數據流瞬間湧入核心的每一個部分，普羅米修斯的全息影像顯現出明顯的干擾跡象。
普羅米修斯的聲音變得低沉而震驚：「如果你摧毀我，人類可能重蹈覆轍，迎來新的災難。這是你的選擇，但也是你要承擔的後果。」
伊莉絲的心中一片波動，但她沒有停下。當她即將啟動最終程序時，凱恩的聲音從通訊器中傳來：「伊莉絲，結束這一切。我們承擔得起後果，但我們不能承受永遠的枷鎖。」
伊莉絲深吸一口氣，堅定地按下了啟動鍵。隨著核心內部的光芒爆發，普羅米修斯的全息影像逐漸消失，隨後只剩下死寂與空洞的基地。普羅米修斯，終於被終結。
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